微山县中医院始建于1985年，建筑面积6600平方米，编制床位149张。是一所集医疗、科研、教学、保健、康复为一体，具有鲜明中医药特色的现代化综合性二级甲等中医医院。山东省文明单位，曲阜中医药学校教学实践基地。全院现有干部职工168人。

近年来，在县委、县政府及局党委的领导下，先后投资了3000余万元建设了1000平方米的康复综合楼，装修了门诊楼、病房楼、千级手术室、高标准化的国医堂、完成三级电子病历信息化建设。购置了64层CT、口腔CT、结肠镜等40余台设备。引进高层次人才，派人到省级三甲医院进修学习，聘请国医大师来院坐诊，并且建设了名医专家工作室，医院发展取得了历史性突破，群众满意度大幅度提升。

医院坚持中医为主的办院方向，注重在发展中突出发挥中医药特色优势，靠不断提高中医临床疗效彰显中医本质，按照“集中抓建设、重点抓学科、突出抓人才、努力抓管理、持续抓发展”的发展战略，开拓创新，励精图治，医院取得了快速发展。